Základná časť Slovnaft extraligy bude mať štyridsaťosem kôl. Po nej bude súťaž pokračovať nadstavbovou fázou v dvoch skupinách. Mužstvá na 1. až 6. mieste zohrajú medzi sebou desať kôl systémom každý s každým, družstvá na 7. až 13. mieste sa taktiež stretnú dvojkolovo, každý s každým. Po nadstavbe bude pokračovať „klasické“ play off s ôsmimi najlepšími účastníkmi, no v budúcej sezóne sa prvýkrát bude hrať aj skupina o záchranu, kde sa tímy na 9. a 12. mieste stretnú každý s každým dvojkolovo doma a vonku. Družstvá, ktoré skončia v tabuľke Slovnaft extraligy na 11. a 12. mieste, budú hrať ešte navyše baráž s dvoma najlepšími tímami prvej ligy o extraligovú príslušnosť v sezóne 2009/2010. „Verím, že nový súťažný ročník extraligy bude kvalitatívnejšie na lepšej úrovni ako ten predchádzajúci. Aj preto sme podnikli nové kroky.“
Novým tímom slovenskej najvyššej súťaže bude HC 05 Banská Bystrica, ktorý vyhral uplynulý ročník 1. ligy. Podľa tvrdenia šéfa Pro Hokeja Vladimíra Paštinského však do začiatku septembra musí splniť všetkých sedemnásť podmienok, ktoré klubu vytýčila kontrolná komisia tejto riadiacej firmy.
Vladimír Paštinský ešte pred žrebovaním nového ročníka vysvetlil aj fakt, že pre dve dvojičky tímov z miest, ktoré ležia tesne vedľa seba, teda Zvolen - Banská Bystrica a Poprad - Kežmarok, vedenie súťaže dva kolektívy z tohto kvarteta vopred nasadilo, aby ich súboje časovo nekolidovali a vyhovovali hlavne fanúšikom. Generálny manažér Zvolena Ivan Piovarči vyžreboval pre HKm päťku a generálny manažér Popradu Tibor Turan trojku. „Urobili sme to preto, aby si Zvolen s Banskou Bystricou a Poprad s Kežmarkom nebrali navzájom fanúšikov. Veríme, že naša extraliga bude pre divákov aj naďalej takým lákadlom, akým bola v uplynulej jubilejnej 15. sezóne, v ktorej všetky zápasy Slovnaft extraligy videlo spolu 1 200 000 divákov,“ vysvetlil Roman Štamberský, športový riaditeľ SZĽH. Neostáva nám teda nič iné, len dúfať, že extraliga opäť naberie stúpajúcu tendenciu.
Žreb 1. kola extraligy 2008/09: HC Košice - HC Slovan Bratislava, MHC Martin - Dukla Trenčín, HC ´05 Banská Bystrica - Ski Park MHK Kežmarok, MsHK GARMIN Žilina - HK ARDO Nitra, HK Aquacity ŠKP Poprad - HKm Zvolen, HK 32 Liptovský Mikuláš - HK SR 20, HK 36 Skalica má voľno.